بررسی تنوع ژنتیکی و احتمال وقوع نوترکیبی در جدایههای ویروس موزاییك هندوانه با استفاده از … |
3-3-1- آزمون الیزای غیر مستقیم…………………………………………………………………………………………. 35
3-4- آزمون PCR. 36
3-4-1- استخراج RNA و ساخت cDNA.. 36
3-4-2- مرحله PCR. 37
3-4-2-1- آغازگرهای اختصاصی.. 38
3-5- روش تهیهی ژل و انجام الکتروفورز برای بررسی نتایج آزمون PCR…………………………………. 39
3-6- ترادفیابی محصول PCR. 40
3-7- تجزیه و تحلیل دادهها 40
4-1- نتایج آزمون الایزا 42
4-2- نتایج آزمون RT-PCR. 43
4-3- تنوع ژنتیکی بین جدایههای WMV……………………………………………………………………………… 46
4-4- نوترکیبی بین جدایههایWMV…………………………………………………………………………………… 47
4-5- مقایسه شباهتها و تفاوتهای ناحیه CP جدایههای WMV در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی 52
6- موتیفهای موجود در جدایه WMV ………………………………………………………………………………. 55
فصل پنجم:
بحث……………………………………………………………………………………………………………………………….. 57
پیشنهادات اجرایی و پژوهشی…………………………………………………………………………………………………. 62
منابع………………………………………………………………………………………………………………………………… 63
فهرست جدولها
جدول 1-1- برآورد سطح، تولید و عملکرد در هکتار محصولات زراعی استان گلستان…………………… 4
جدول 3-1- تعداد نمونه و مزارع نمونه برداری شده در استان گلستان……………………………………….. 35
خرید متن کامل این پایان نامه در سایت nefo.ir
جدول 3-2- مواد لازم در واکنش PCR………………………………………………………………………………… 38
جدول 3-3- شرایط و سیکلهای حرارتی برنامه ریزی شده برای انجام PCR ……………………………… 38
جدول 3-4- دو جفت آغازگر اختصاصی WMV از ناحیه CP-UTR ………………………………………… 39
جدول 4-1- تنوع ژنتیکی و نسبت جانشینی آمینواسیدی در جدایههای مختلف WMV در جمعیتها و گروههای فیلوژنتیک 47
فهرست شكلها
شکل 4-1- علایم بیماری ویروسی WMV روی برگ و میوه هندوانه…………………………………………. 42
شکل 4-2- نتایج آزمون PCR در ژل آگارز………………………………………………………………………….. 43
شکل 4-3- درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده به روش neighbor joinig………………………………………. 45
شکل 4-4- گراف نوترکیبی ترسیم شده با استفاده از نرمافزار RDP3 در جدایه یزد که قطعه نوترکیب از جدایه اصفهان است 48
شکل 4-5- گراف نوترکیبی ترسیم شده با استفاده از نرمافزار RDP3 در جدایه چین که قطعه نوترکیب از جدایه شیلی است 49
شکل 4-6- گراف نوترکیبی ترسیم شده با استفاده از نرمافزار RDP3 در جدایه ژاپن که قطعه نوترکیب یکی از جدایههای فرانسه است 50
شکل 4-7- گراف نوترکیبی ترسیم شده با استفاده از نرمافزار RDP3 در جدایه فرانسه که قطعه نوترکیب یکی دیگر از جدایههای فرانسه است 51
شکل 4-8- درصد شباهت و تفاوت جدایه WMV گلستان با سایر جدایههای این ویروس در دنیا بر اساس همردیف سازی ترادفهای نوکلئوتیدی ژن CP 53
شکل 4-9- درصد شباهت و تفاوت جدایه WMV گلستان با سایر جدایههای این ویروس در دنیا بر اساس هم ردیف سازی ترادفهای آمینواسیدی ژن CP 54
-1- گیاهشناسی محصولات جالیزی (کدو، خیار، خربزه، هندوانه)
به طورکلی سیستم ریشهای گیاهان صیفی زراعی، گسترده اما کم عمق است و بیشتر ریشهها در یک متری فوقانی خاک قرار دارد. ساقه اصلی از محور گیاهچه رشد میکند و ممکن است شاخههای جانبی کم یا زیاد (8 یا بیشتر) داشته باشد که از گرههای نزدیک قاعده ساقه بیرون میآیند. در هیچ یک از گیاهان صیفی عوامل خود ناسازگاری شناخته شده وجود ندارد (امیر اصلانی، 1384).
تیره كدوئیان شامل 100 جنس و حدود 1000 گونه است. برگهای این گیاهان، ساده، متناوب، دارای دمبرگ دراز و پهنك كامل یا لوبدار و در هرحال فاقد استیپول است. گلهای آنها منظم، یكپایه، مركب از قطعات 5 تایی، منفرد یا مجتمع به صورت گرزن است (بیتس و همکاران، 1990). نباتات خانواده کدوئیان تمام خزنده و ساکن نواحی گرم و بنابراین حساس به سرما میباشند. هرچند که قسمت مورد استفاده گیاهان خانواده کدوئیان میوه آن میباشد معهذا این گیاهان را جزو سبزیها قرار دادهاند (شیبانی، 1364).
در جنس Cucumis دو نوع گیاه قرار میگیرد یکی انواع خربزه و طالبی (C.melo) و دیگری خیار (C.sativus). در جنس Cucumis مانند سایر افراد خانواده کدوئیان بوتهها بیشتر یک پایه هستند ولی گاهی گیاه دوپایه و ندرتاً گل دوجنسی در بوتههای خربزه و خیار دیده میشود. از نظر گیاهشناسی بوته خربزه و خیار بسیار شبیه به یکدیگر میباشند یعنی در هر دو گیاه برگها گرد قلبی شکل بوده و دارای رنگ سبز روشن میباشد ولی رشد بوته خربزه خیلی زیادتر از رشد بوته خیار است، گلهای نر و ماده از هم جدا و در بغل برگها قرار دارند (شیبانی، 1346).
بوته هندوانه (citrullus lanatus)گیاهی است یکساله از خانواده کدوئیان که دارای شاخههای خزنده میباشد. برگ بوته هندوانه تقریباً قلبی شکل و دارای بریدگیهای عمیق است و اغلب این بریدگی اصلی دارای بریدگیهای فرعی یا ثانوی میباشد. گلهای نر و ماده همیشه از هم جدا هستند ولی روی یک پایه قرار دارند (شیبانی، 1346).
انواع کدوها از جنس Cucurbita و از خانواده Cucurbitaceae میباشند. این گیاهان مانند سایر جنسهای این خانواده یک پایه و گرمسیری و اغلب یکساله هستند و انواع کدوهای اهلی که میوه آنها مورد استفاده انسان قرار میگیرد از سه گونه مشخص مشتق میشـوند که عبارتنـد از: 1- Cucurbita pepo. 2- Cucurbita moschata. 3- Cucurbita maxima. انواع کدوهای ایران نیز که به سه دسته تقسیم میشوند از سه جنس نامبرده هستند به این ترتیب که کدوی مسمایی از نوع C. pepo و کدوی حلوایی یا رشتی از نوع C. moschata و کدوتنبل از نوع C. maxima هستند (شیبانی، 1346).
فرم در حال بارگذاری ...
[شنبه 1400-05-16] [ 05:20:00 ب.ظ ]
|